Les logiciels indiqués sont ceux qui sont vérifés pour fonctionner :

• arb: 22-Aug-2003
• ClustalX
• emboss: 3.0.0
• fastLINK: 4.1P
• fastSLINK     
• HYPHY: 0.99
• kgeography
• MuGen: 20060919
• Molmol: release 2K.2
• perl-Bioperl
• NMRVievJ
• PHYML: 2.4.4
• plplot
• PyMOL:0.98
• R-base
• R-bioconductor
• SHOW: 20060919
• SPDBV: 3.7 sp5
• spim     
• vmd     
• xplor     2.17
• Acrobat Reader     7.0.9
• bluej     2.1.3
• caml-light     0.74
• Codecs Mplayer     
• ddd     
• eclipse     
• flash player     9.0.31
• plugin flash     
• gcc     
• gcc-colorgcc     
• gcc-cpp     
• gcc-g77     
• gnuplot     
• gsl     
• java     1.5 update 10
• ocaml     
• PROLOG: gprolog swi-prolog     
• Poseidon for UML : Community Edition     
• scilab     
• tcl tk     
• tcl-devel     
• tk-devel     
• grace     
• xxgdb

Les logiciels rajoutés manuellement sont disponibles depuis /usr/local/bin